Kennzeichnend für die ökologisch-ökonomische Forschung ist eine Vielfalt von methodologischen Ansätzen, die sich drei verschiedenen Paradigma-Ebenen zuordnen lassen: einer naturwissenschaftlich geprägten Ebene (Systembetrachtung, Entropieanalyse, Nachhaltigkeitsforschung), einer wirtschaftswissenschaftlichen Ebene (modifizierte Nutzen-Kosten-Analyse, Untersuchung umweltpolitischer Instrumente) und schließlich einer sozialwissenschaftlich-philosophischen Ebene (politische Durchsetzungsstrategien, Umwelt- und Verteilungsethik). Die einzelnen Ansätze werden exemplarisch erläutert anhand der einschlägigen Ergebnisse der Klimaschutzforschung.